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微流控技術研究細菌耐藥性

微流控技術研究細菌耐藥性

TB:微流控技術在應對耐藥性上的應用(綜述)-Trends in Biotechnology

微流控技術可應用于細菌性質研究、細菌藥敏實驗、培養“無法培養”的細菌以篩選新型抗生素等領域;

② 利用微流控技術研究細菌的抗生素耐藥性問題,具有縮減分析規模、局部環境精確控制、速度快、精度高、成本可控等優勢;

③ 微流控技術存在缺陷包括:微流控器械所需的材料較難獲得、微流控環境可能對樣品內的細菌有害等;

④ 在微流控技術領域研究進展迅速的同時,其實際應用轉化卻遲遲未達預期,仍需在商業化領域進行更多的探索與嘗試。

Microfluidics for Combating Antimicrobial Resistance

2017-08-08  DOI: 10.1016/j.tibtech.2017.07.008

EP:冰川土壤、永久凍土及沉積物中的抗生素耐藥基因 - Environmental Pollution

利用宏基因組分析以下三種樣品中的抗生素耐藥基因(ARG)和可移動遺傳元件(MGE);

② 樣品包括:受人為活動影響較小的冰川土壤、距今5821年的的深層永久凍土和珠江沉積物;

③ 沉積物中的ARG和MGE比冰川和永久凍土更豐富,其中的耐藥性機制類型也更多,磺胺類藥物,四環素類藥物和氟喹諾酮類藥物很常見;

④ 凍土中沒有發現磺胺類藥物和四環素類藥物,四環素在冰川土壤中也沒有發現;

⑤ MGE的多樣性與ARG的豐度和多樣性顯著相關。

Distribution of ARGs and MGEs among glacial soil, permafrost, and sediment using metagenomic analysis

2017-11-28  DOI: 10.1016/j.envpol.2017.11.031

EP:冰川土壤、永久凍土及沉積物中的抗生素耐藥基因

Cell子刊:抗生素可不通過菌群削弱自身效果并改變宿主免疫功能 - Cell Host and Microbe

采用8周齡C57BL/6J小鼠,建立模型,腹膜大腸桿菌感染接受抗生素治療后,對宿主微環境中局部代謝產物的變化進行分析;

② 抗生素治療可耗盡腹膜內的中樞性代謝中產物,通過直接作用于宿主細胞,產生不依賴于菌群的局部代謝產物變化;

③ 治療過程中產生的代謝產物如AMP,削弱抗生素療效,加強吞噬細胞的殺傷作用;

④ 抗生素自身可通過損傷線粒體、抑制免疫細胞的呼吸功能而干擾免疫功能,降低吞噬細胞的殺傷作用。

Antibiotic-Induced Changes to the Host Metabolic Environment Inhibit Drug Efficacy and Alter Immune Function

2017-11-30  DOI: 10.1016/j.chom.2017.10.020

抗生素可不通過菌群削弱自身效果并改變宿主免疫功能

SR:孕婦分娩期用抗生素,嬰兒菌群成熟推遲 - Scientific Reports

比較未接觸抗生素的順產嬰兒(53例)、分娩期接受抗生素預防(IAP)B型鏈球菌的嬰兒(14例)和剖腹產嬰兒(7例)的生命早期菌群演替;

② 對于IAP組順產孕婦的后代嬰兒,在出生后的12周內,雙歧桿菌(在嬰兒腸道中占主導地位)擴增延遲,并表現出埃希氏菌屬的持留;

③ IAP暴露的時間越長,對雙歧桿菌種群的影響程度越大,表明菌群成熟的延遲更長;

④ 剖腹產改變腸道定殖,包括擬桿菌門缺乏。

Intrapartum antibiotics for GBS prophylaxis alter colonization patterns in the early infant gut microbiome of low risk infants

2017-11-28  DOI: 10.1038/s41598-017-16606-9

孕婦分娩期用抗生素,嬰兒菌群成熟推遲

Cell子刊:皮膚上常駐 vs 病原葡萄球菌的競爭模式 - Cell Host and Microbe

凝固酶陰性葡萄球菌(CoNS)和金黃色葡萄球菌是人類和其他哺乳動物體內天然菌群的一部分;

② 培養過CoNS菌種的山羊葡萄球菌的廢棄培養基,能夠抑制所有種類金黃色葡萄球菌引起的agr介導的群體感應;

③ 山羊葡萄球菌自誘導信號肽(AIP)可能負責抑制群體感應,AIP是一個八殘基的硫內酯肽;

④ 在皮膚感染模型中,山羊葡萄球菌AIP減弱耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(MRSA)誘導的壞死和負荷;

⑤ 在皮膚定殖和感染過程中,山羊葡萄球菌與MRSA直接競爭。

Coagulase-Negative Staphylococcal Strain Prevents Staphylococcus aureus Colonization and Skin Infection by Blocking Quorum Sensing

2017-11-30  DOI: 10.1016/j.chom.2017.11.001

皮膚上常駐 vs 病原葡萄球菌的競爭模式

AR:腸道菌群在多發性硬化中的作用(綜述) - Autoimmunity Reviews

共生菌群可引發自身免疫性髓鞘脫失,是多發性硬化(MS)的環境危險因素;② 共生菌群在宿主體內參與免疫系統調節,改變生物屏障的完整性和功能,并對中樞神經系統產生影響;

③ 腸道微生態失調是MS的臨床特點之一,MS患者腸道中梭菌屬、擬桿菌門及其它具有免疫調節的細菌(例如Adlercreutzia)減少;

④ 因缺乏梭菌屬菌株產生的短鏈脂肪酸,MS患者體內的Treg功能受到抑制;⑤ 調節共生菌群是一個有效的治療方向,有助于改善患者的臨床醫治結果。

Combined therapies to treat complex diseases: The role of the gut microbiota in multiple sclerosis

2017-11-27  DOI: 10.1016/j.autrev.2017.11.019

腸道菌群在多發性硬化中的作用

SR:利用培養過艱難梭菌的上清培養糞菌的結果 - Scientific Reports

挑選含有六種不同艱難梭菌的培養上清的2種條件培養基,用于培養糞便菌群,2種條件培養基中,菌群多樣性都顯著降低;

② 大多數的差異發生在厚壁菌門中,具有潛在保護功能的腸道共生菌(如乳桿菌屬、梭菌屬XIVa)減少,條件致病菌(如腸球菌屬)增加;

③ 兩種條件培養基中的細菌種群不同,可能與營養物的可利用性有關;

④ 含有大腸桿菌、腸炎沙門氏菌或表皮葡萄球菌的培養上清的條件培養基,培養的糞便菌群與艱難梭菌條件培養基中的明顯不同。

Evaluating the effect of Clostridium difficile conditioned medium on fecal microbiota community structure

2017-11-27  DOI: 10.1038/s41598-017-15434-1

利用培養過艱難梭菌的上清培養糞菌的結果

GM:IBD患者腸道里富集的活潑瘤胃球菌 - Genome Medicine

20名IBD患者和12名健康人的每月糞便樣品(266個)進行宏基因組測序,發現患者體內可耐受增加的腸道氧化應激的兼性厭氧菌豐度明顯升高;

② IBD患者體內的活潑瘤胃球菌大量增殖,且通常與疾病活動度增加同時發生,鑒定出兩種金黃色葡萄球菌,其中一種在IBD患者體內富集;

③ 對IBD患者體內分離的9個菌株進行測序,鑒定了199個參與氧化應激反應、粘附、鐵獲取及粘液利用的IBD特異性、菌株特異性基因;

④ 上述基因賦予活潑瘤胃球菌適應性優勢。

A novel Ruminococcus gnavus clade enriched in inflammatory bowel disease patients

2017-11-28  DOI: 10.1186/s13073-017-0490-5

IBD患者腸道里富集的活潑瘤胃球菌

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